在一些方面，本公开内容提供了用于富集包含至少两个或更多个拷贝的靶多核苷酸的多联体的扩增子或扩增产物的方法。在一些实施方案中，方法包括对包含至少两个或更多个拷贝的靶多核苷酸的扩增子进行测序。在一些实施方案中，所述靶多核苷酸包含由染色体重排产生的序列，该染色体重排包括但不限于点突变、单核苷酸多态性、插入、缺失和包含融合基因的易位。在一些方面，本公开内容提供了在所述方法中有用的组合物和反应混合物。