本发明公开一种电气化铁路分区所自动过分相系统及方法，该系统包括：受电弓识别仪，用于感知列车的行驶位置及方向；电压互感器，用于检测第一供电臂的电压；第一电阻和第一晶闸管开关，分别并联在第一分段器两端；第二电阻和第二晶闸管开关，分别并联在第二分段器两端；以及控制单元，用于：在所述列车从所述第一供电臂驶向所述第一分段器的情况下，在所述第一供电臂的电压过零时，控制所述第一晶闸管开关导通；在所述列车从所述第一供电臂经所述第一分段器进入中性段的情况下，控制所述第一晶闸管开关关断，此时通过第一晶闸管开关的电流过零，同时控制所述第二晶闸管开关导通；以及在所述列车从所述中性段经所述第二分段器进入所述第二供电臂的情况下，控制所述第二晶闸管开关关断。