本发明公开一种基于分屏模式下应用交互的方法、设备和存储介质，属于终端分屏处理技术领域。该方法包括：在同一移动终端的第一屏幕界面上启动控制应用，第二屏幕界面上启动响应应用，并存储所述控制应用的第一输入通道及所述响应应用的第二输入通道；在所述控制应用上接收用户的输入事件，并按预设规则进行映射转换，以将所述输入事件由所述第一输入通道映射到所述第二输入通道；在所述响应应用上响应所述输入事件所对应的动作。本发明的技术方案，其可实现当移动终端处于分屏模式下，用户可使用其中的一个屏幕作为控制端，操控另一个屏幕上的应用的功能。