本发明公开了一种高效生物降解霉菌毒素的制剂及其制备方法与应用，属于微生物技术领域。所述高效生物降解霉菌毒素的制剂包含枯草芽孢杆菌、凝结芽孢杆菌、酿酒酵母菌、屎肠球菌和植物乳杆菌。本发明进一步公开了制备所述高效生物降解霉菌毒素的制剂的方法，以及所述高效生物降解霉菌毒素的制剂的应用方法，侵染霉菌毒素的饲料添加本发明制备得到的制剂进行发酵，能降解原料中黄曲霉毒素、玉米赤霉烯酮和呕吐毒素，降低霉菌毒素对动物的毒害，本发明的制剂能减少受霉菌毒素浸染的原料的浪费问题，提高饲料利用率，提高饲料原料的营养价值，促进动物生长，改善动物的健康状态，实现减抗替抗的目的。