本发明实施例提供了一种基于虚拟桌面的工作流程管控方法和系统，采用集群服务器对所有服务器的工作所需数据资源和计算资源进行统一管理；根据接收到的分阶段工作任务请求，生成不同阶段虚拟机资源的配置以及工作所需数据资源的访问请求；根据不同阶段虚拟机资源的配置以及工作所需数据资源的访问请求，生成虚拟桌面，并将工作所需数据资源存储在虚拟桌面中。将生成对应的账号和密码并将其发给用户终端，用户通过收到的账号和密码访问虚拟桌面进行工作，根据审核用户提交的阶段性工作成果，判断是否继续运行虚拟桌面。客户通过终端远程访问虚拟桌面进行工作，从而提高资源利用率和工作效率，完善管理现状。