本发明提供基于盲源分离与时频脊波域滤波的电离层杂波抑制方法，属于雷达信号处理技术领域。本发明首先通过盲源分离方法对雷达阵列天线接收的信号进行源信号分离，并对分离成分按信杂噪比从小到大进行排列；然后分别对雷达阵列天线接收的信号以及重新排序后的分离成分在杂波与目标所在波束方向进行波束形成，用接收信号波束形成结果逐个对消分离成分波束形成结果，选出其中信杂噪比最大的对消结果；最后对对消后的结果进行时频‑脊波域滤波处理，进一步提高信号的信杂噪比。本发明解决了现有电离层杂波抑制技术在信杂噪比较低情况下，杂波抑制效果差的问题，相对现有技术杂波抑制性能更优。本发明可用于高频雷达的超视距探测面对的强杂波问题。