本发明涉及一种分步分子印迹法，及通过该方法得到的分子印迹材料。本发明将分子印迹的过程分成两步进行，第一步选用的功能单体有两方面的作用，一是与模板分子有一定的相互作用，可以通过印迹过程形成印迹位点，二是聚合反应完成后，仍含有可进一步反应的活性基团，为第二步印迹提供条件。第二步选用的功能单体则首先需要能与一次印迹结束后的表面活性基团进行共价反应，其次可提供与模板分子表面区域之间新的相互作用。本发明引入两类反应条件不同的功能单体，从而使对模板分子的精细识别能力大大提高，亲和力也明显增强。