本发明公开了一种日本白鲫和红鲫杂交品系的建立方法，分别以经人工诱导雌核发育得到的雌性日本白鲫和雄性红鲫为母本和父本，经杂交获得的后代进行饲养，筛选得到两性可育的二倍体合方鲫F₁；培育二倍体合方鲫F₁，自交繁殖后获得两性可育的合方鲫F₂，至少经过两次连续自交得到两性可育的二倍体合方鲫F_n，形成遗传性状稳定、两性可育的二倍体杂交鲫品系，该品系在鱼类遗传育种和生物进化方面具有重要意义，为培育新型优良鲫鱼提供了优质的种质资源库。本发明还公开了一种合方鲫2号的培育方法，以合方鲫F₁为母本，与雄性日本白鲫回交育种得到。该方法简单易操作，得到的合方鲫2号头小背高，生长速度快，肉质甜而鲜嫩，抗逆抗病能力强。