本发明公开了飞机与机械操纵系统变形差异对机动操纵影响设计方法，包括以下步骤：1)根据飞机机动时合力与合力矩的要求，计算飞机机动时的纵、横、航向机动所需舵面偏度；2)计算飞机机动过程中机械操纵系统相对于飞机变形的偏离量；3)计算飞机机动过程中飞机的座舱操纵位移及操纵力；4)根据飞机机动时的不同目标过载，重复步骤1－步骤3，得到飞机机动时的纵、横、航向的座舱操纵位移、操纵力对对应目标过载的杆力梯度、杆位移梯度，本发明实现了飞机在飞行中真实的机械操纵系统特性确定流程，以及真实的飞机机动操纵特性设计确定方法，保证了飞行与设计的一致性，修正了机械操纵系统特性误差，提高了飞机飞行的安全性，改善了操纵品质。