本申请所提供的一种人脸毛孔跟踪方法，包括：获取表情变化视频连续的两帧图片；利用稠密光流算法对两帧图片进行计算得出光流图；对两帧图片进行SLIC超像素分割得到二维超像素块集；利用光流图对二维超像素块集进行处理分别得到三维超像素块集以及对应的变换矩阵；利用组合优化函数对三维超像素块集及变换矩阵进行处理得到优化变换矩阵；利用各个毛孔特征点的坐标以及优化变换矩阵分别得到各个毛孔特征点对应的三维变化向量。可见，该方法获取了毛孔特征点运动轨迹的优化变换矩阵即精确的运动轨迹参数，进而提高毛孔特征点跟踪的准确率。本申请还提供一种表情变化人脸毛孔跟踪系统、计算机及计算机可读存储介质，均具有上述有益效果。