本发明公开一种燃料电池载货车的全底盘布置结构，包括车架、燃料电池发动机、动力电池、储氢装置、电驱动桥系统、电机控制器及冷却系统。燃料电池发动机布置于传统柴油车发动机的位置处，动力电池布置于燃料电池发动机的后方，两个储氢装置对称地布置于动力电池的两侧，电驱动桥系统布置于两个后轮之间，电机控制器布置于车架的尾部。冷却系统包括辅机冷却系统、电堆冷却系统及电机冷却系统，辅机冷却系统布置于车架的前悬处，电堆冷却系统布置于燃料电池发动机的前方，电机冷却系统布置于车架的尾部，同时布置于后轮的后方。本发明整车重心低、安全性高，提高货箱空间利用率。采用三套冷却系统，对不同的部件起到相应的散热作用。