本发明公开一种基于改进遗传算法的微电网经济运行优化方法：1)建立经济运行优化模型；2)算法初始化；3)对种群个体进行混沌处理及映射，形成初始化种群矩阵；4)计算种群适应度，记录最优个体；5)选择、纵横交叉及变异操作；6)判断种群是否满足最大偏差相似性准则，进行编码形成矩阵；7)判断矩阵的个体是否线性相关，若是，进行混沌处理，返回步骤5)；否则，执行步骤8)；8)计算种群适应度，更新最优个体位置；9)判断是否达到最大迭代次数；若是，输出最优解；否则，返回步骤5)。本发明克服了现有微电网经济运行优化方法对空间搜索能力有限，求解优化模型时容易陷入局部最优的缺陷，为微电网经济运行优化提供一种新方法。