本发明涉及了一种火星探测器自主唤醒控制系统及方法。出火夜后，太阳电池阵通过休眠供电支路输出功率提供给蓄电池组加热带；随着太阳阵输出功率逐步增大，母线电压升高，达到唤醒门限后，电源模块开关唤醒电路工作，输出电源开关唤醒信号至温度继电器；温度继电器处于断开状态；随着太阳电池阵输出功率增大，蓄电池组温度逐步升高，达到蓄电池组工作温度后，温度继电器自动接通，电源开关唤醒信号驱动电源模块开关动作，将电源模块接入母线，同时将加热带切除；电源模块工作，产生工作电源，工作电源经放电与母线切换开关唤醒电路产生放电开关唤醒信号和母线切换开关唤醒信号，分别驱动放电开关和母线切换开关自动闭合，完成自主唤醒。