本发明公开了一种药品采购优化方法及系统，涉及采购领域，该方法包括基于每家供应商的报价药品集合，计算每家供应商报价药品集合的替代率、医保率和历史采购率；基于计算出的替代率、医保率和历史采购率，计算每家供应商每种药品的排序权重值；根据每家供应商报价药品集合，统计出至少有两家供应商进行报价药品的集合，记为第一集合，并计算出第一集合中药品的替代率、医保率和历史采购率；计算第一集合中药品对应的每家供应商所有药品的排序权重值并进行排序，取设定名次对应的供应商作为本次待选择供货商。本发明能够有效解决医疗机构采购订单的合理分配问题，保障医疗机构采购满足率同时减轻医疗机构采购完成后的收货的环节工作量。