本发明提供了提高菌阴结核感染检测敏感性的标志物组合及应用，具体地，本发明提供了两种蛋白组合物，所述的蛋白组合物可以用于检测结核分枝杆菌感染，一种用于检测结核分支杆菌和非结核分支杆菌的低负荷感染和菌体检测阴性的人群和高风险人群筛查的敏感性，另一种用于临床诊断结核分支杆菌所需的特异性。两种指标蛋白组合可以满足不同应用场景下对结核分支杆菌和非结核分支杆菌敏感性和特异性的不同需求。本发明还提供了现场快速检测的方法，可用于疾病控制机构、偏远欠发达地区卫生机构、和家庭对疑似结核感染的现场快速发现。