本发明实施例公开了一种用于制备生物燃料的系统及方法，所述方法为将从空气中固定的二氧化碳、超纯水在酵母菌和酶作用下生成含有短链脂肪酸溶液；在所述含有短链脂肪酸溶液加入甲醇，在所述甲醇的参与下，生成长链脂肪酸；所述长链脂肪酸经羧酸还原和醛的还原反应，生成烷烃，所述烷烃与燃料混合得到生物燃料。所述系统包括二氧化碳固定和短链脂肪酸合成装置、长链脂肪酸生成装置、脂肪酸还原和烷烃生成装置以及稳定化装置。本发明实施例将空气中的二氧化碳加以回收和固定，并将其注入水中，水中的氢离子加以活用，制成与燃料油相似的长链(C₁₅以上)的烷烃，达到削减二氧化碳的目的，降低温室效应的发生。