本申请公开了一种恶意应用程序的检测方法及装置。该方法中获取待检测应用程序的证书序列号和程序特征信息，程序特征信息为待检测应用程序设定的待运行的信息，程序特征信息包括调用接口、系统命令和申请权限中的至少两种特征信息；根据预设的证书序列号黑名单，对证书序列号进行检测，证书序列号黑名单包括已知恶意应用程序的证书序列号；若预设的证书序列号黑名单中存在证书序列号，则确定待检测应用程序为恶意应用程序；若预设的证书序列号黑名单中不存在证书序列号，则根据程序特征信息，确定待检测应用程序是否为恶意应用程序。该方法提高了检测准确性与检测效率、降低了测试成本。