本发明公开了一种黑枸杞中总黄酮、提取方法、应用，将黑枸杞洗净干燥后粉碎备用；使用氯化胆碱型低共熔溶剂作为提取剂，采用辅助提取获得黄酮提取液；氯化胆碱型低共熔溶剂中，合成低共熔溶剂的氢键受体为氯化胆碱，氢键供体为乙酰丙酸、乳酸、乙二醇、尿素和1,3‑丁二醇中的至少一种；将黄酮提取液采用大孔树脂吸附并采用有机试剂分离纯化得到纯化的黄酮提取液；将纯化的黄酮提取液旋蒸后添加聚乙二醇，真空冷冻干燥得到产品。本发明的方法简单可靠，提取率高，为提高黑枸杞黄酮的利用率提供了参考依据。低共熔溶剂提取是一种绿色提取方法，不需要采用大量的有机试剂提取，本发明所述的DES可以作为一种绿色环保，具有高提取率的黑枸杞黄酮提取剂。