本发明属于多糖提取技术领域，具体涉及一种褐藻糖胶的提取方法及其应用。所述方法包括粗提和提纯，所述粗提过程为将原材料粉碎，用醋酸水溶液先浸泡提取，过滤，保留滤液，并将滤饼在醋酸水溶液中加热至30‑40℃搅拌二次提取，过滤，将两次滤液合并，调至中性，进一步加入乙酸乙酯萃取，其中有机层提取了色素，分离的水层用乙醇沉淀法，获得褐藻糖胶的粗提物。本发明提供的技术方案在粗提阶段，在较温和的温度和pH值条件下最大限度避免了褐藻糖胶的破坏，硫酸盐含量较高，另外在粗提阶段进行了脂溶性特别是色素物质的萃取，这一操作不仅使得褐藻多糖得率有所提升，并且为褐藻黄素的回收利用提供了可能，增加了原材料的综合利用度。