本发明提供了一种块体结构三维建模方法及系统。其中，一种块体结构三维建模方法，包括构建掌子面所在平面；选取迹线生成结构面；拟合迹线组投影面：使用同一组迹线且每条迹线的前两点拟合迹线组投影面；判断迹线组投影线封闭性：将迹线投影到投影面，判断投影迹线组是否封闭，如果封闭，则计算所有结构面与迹线投影面相交线；如果不封闭，则计算位于边墙的迹线和掌子面交点是否是两个，若是，则计算所有结构面与掌子面所在平面相交线；若不是，则重新选取迹线生成结构面；相交线构面：采用所有结构面、掌子面和迹线投影面上的相交线构建封闭面，作为块体的面。