本实用新型提供了一种用于污水处理系统的生物过滤装置，生物过滤装置设置在沉淀区和清水区之间，生物过滤装置包括填料层，填料层将生物过滤装置的空腔分隔形成位于上部的进水腔和位于下部的出水腔，进水腔与沉淀区的顶部连通，出水腔与清水区的底部连通，出水腔内设有反洗曝气管，进水腔设有反洗出水口，反洗出水口与污泥贮留槽或预脱硝区相连。由此，本实用新型具有能够有效去除悬浮固体颗粒值，降低出水氨氮值和出水化学需氧量值，其流程简单、易操作的优点。