本实用新型涉及一种方便处理废液的磁性分离装置，属于生物分离技术领域领域。它包括安装板，在安装板上方设置有磁铁，磁铁通过固定结构架设于安装板上，在安装板上设置有支撑板，在支撑板上开设有若干个小孔，每四个相邻的小孔之间设置一个磁铁，固定结构包括固定板和固定凹槽，磁铁设置在凹槽内，在支撑板上方设置有盖板，在盖板上设置有若干个导向孔，导向与小孔一一对应设置，在小孔内插接有PCR管，在导向孔内设置有限位环，在盖板上方还设置有收集装置。本实用新型涉及的方便处理废液的磁性分离装置，通过盖板和收集装置的设置，不仅能够保证分离过程的密封性，而且在分离结束后可以方便快捷的将废液进行收集，防止废液产生污染。