本实用新型公开了一种污水处理厂次氯酸钠消毒系统，包括消毒区、设置在消毒区两侧的进水管和出水管、为消毒区提供次钠的加药箱，所述进水管上安装有流量计，所述消毒区内安装间隔设置的隔水板；在消毒区的进水区和出水区分别安装有氨氮仪表和余氯仪表；所述消毒区的进水区和出水区均设置有加药管，所述加药管上安装有加药泵，且加药管上安装有流量计，所述加药泵与加药箱通过管路连接，且两加药管的出料端均连接有具有缓释混匀功能的混匀缓释箱。本实用新型的污水处理厂次氯酸钠消毒系统，第一加药点根据进水流量，和进水氨氮设置投加量，在第二加药点根据进水流量和检测的余氯值进行加药，保证出水余氯值稳定。