本实用新型公开了一种净水工艺次氯酸钠消毒系统，包括次氯酸钠储存罐，次氯酸钠储存罐连接有第一输送管，第一输送管的另一端连接有储存罐，第一输送管上安装有Y型过滤器，第一输送管上连接有第一自来水反冲洗管，次氯酸钠储存罐上连接有第二输送管，第二输送管的另一端与储存罐连接，储存罐上连接有第六输送管，使用次氯酸钠进行消毒，在消毒的前提下能够大大降低水中消毒副产物的产量，取得更好的出水水质；同时次氯酸钠相对于氯气挥发性小，腐蚀性小，并且次氯酸钠在采购、运输、储存、现场制备、使用手续等方面相对简便，提高了安全性,通过搅拌电机对搅拌杆进行驱动，使得溶液混拌，从而达到提升浓度的效果，混合均匀。