本实用新型公开了液相色谱仪柱温箱控温系统，涉及化学分析检测技术领域。液相色谱仪柱温箱控温系统，包括液相色谱柱、恒温箱和换热部，液相色谱柱安装在恒温箱内，恒温箱的长边对应的一面上设有换热部，换热部包括至少两个换热装置，换热装置包括半导体制冷片和散热器，半导体制冷片一面贴附恒温箱，半导体制冷片另一面贴附散热器，恒温箱内设有温度传感器。通过反向通过电流，还可以使得半导体制冷片对恒温箱进行降温的操作，进一步的通过温度传感器的设置，使得恒温箱内的温度可以实现实时测量，进而可以控制半导体制冷片进行制冷或者制热，从而控制恒温箱的温度在一个精确的范围内。