本实用新型提供一种水肥一体系统的控制设备，包括水肥一体装置、控制部以及上位机，水肥一体装置包括供水管、水泵、主管道、储肥罐、过滤装置以及灌溉装置，供水管一端连接有三通连接管，三通连接一管口通过水管连接自吸式的水泵，另一管口连接与主管道；供水管上还设有三通，三通两接口连接供水管，另一接口朝上通过水管连接设置在主管道上方的储肥罐；过滤装置设置在储肥罐和灌溉装置之间；三通连接管前侧的主管道上设有电动阀，储肥罐与三通之间的水管上设有流量控制阀；控制部包括控制器、与控制器通信连接的触屏显示模块、数据存储模块以及通信模块，通信模块与上位机连接。该设备具有双重水肥混合和过滤步骤，能有效避免滴灌系统滴头堵塞。