本实用新型公开了一种物料自动分选系统，包括主壳体、副壳体和分选辊，副壳体内安装有搅拌轴，搅拌轴上安装有若干个搅拌叶，搅拌轴的下方还焊接有隔板，隔板上设置有导料口，导料口的下方一侧安装有鼓风机；主壳体内部顶端通过支撑架安装有第一传送装置，第一传送装置的另一端下方还安装有向下倾斜的倾斜振动筛，倾斜振动筛的尾端下方设置有第二传送装置，第二传送装置的一端还设置有若干个分选辊，每相邻的两个分选辊之间设置有分选间隙，分选辊的下方还放置有分选盒；该实用新型的物料自动分选系统可以进行果皮、果仁和果壳分离，且果仁通过分选辊进行分选，使不同重量和体积的果仁通过分选间隙掉入不同的分选盒中，分选效率高。