本实用新型涉及一种用于测定微纳米药物制剂包封率的微柱离心分离装置，所述装置包括密封盖、分离管、滤板和收集管，所述分离管的顶部可拆卸密封安装密封盖，该分离管的底部的内壁上设有螺旋纹，所述收集管也沿竖直方向设置，该收集管的顶部的外壁上设有连接螺纹，所述收集管能够通过连接螺纹、螺旋纹与分离管的底部螺纹啮合紧密相连接设置；所述螺旋纹上方的分离管的中下部内壁上紧密同轴设置滤板。本装置在使用时可填装不同类型的分离介质，不仅能够实现游离药物与被包封药物的快速分离，提高测定效率，而且能够实现微柱离心分离装置标准的统一化，使得测定结果的可信度更高。同时，结构简单，可重复使用，易于普及，操作便捷，实用性高。