本实用新型公开了一种外生菌根真菌孢子分离与观察装置，包括传动马达和内置杆，所述传动马达安装在顶板的上表面左侧，所述内置杆的一端焊接固定在传动马达的下表面中心位置，所述底座的上方外部通过安装槽与固定座贯穿连接，所述盛放杯的底部对称固定有弹簧支撑座，所述筛网上表面中心位置固定的连接块与连接杆相互连接，所述连接杆的上方右侧固定有凸块，所述穿槽开设在顶板的左侧内部，所述盖板下表面固定的插板连接在侧边槽中。该外生菌根真菌孢子分离与观察装置，观察倍镜与连接杆对称设置在顶板的两侧，此种设置能够在盛放杯中的真菌孢子分离之后，转动固定座，使得盛放杯能够转动至处于观察倍镜的正下方进行观察。