本实用新型公开了一种防治农业面源污染的清污分流装置，包括过滤箱，所述过滤箱上下端侧壁分别连接有进水管和出水管，所述过滤箱内部固定连接有呈V型结构的过滤网，所所述第一凹槽上连接有对过滤网进行清理的清理装置，所述密封箱内安装有驱动清理装置在过滤网上来回移动的第一驱动装置。本实用新型案例电机输出端固定连接第一横柱，第一横柱通过连接轴与第二横柱转动连接，第二横柱通过连接轴与滑块转动连接，滑块通过横杆与固定连接在V型板上的连接柱固定连接，启动电机，可以使V型板做来回移动，使得V型板下端的刷毛对过滤网上的杂质进行清理。