本实用新型公开了一种防治农业面源污染的清污分流装置，包括设置有开口的箱体，所述箱体内开设有空腔，所述箱体的上侧侧壁上固定设置有第一电机，所述第一电机的驱动端固定连接有第一驱动轴，所述第一驱动轴贯穿箱体设置，所述第一驱动轴的端部固定连接有绞龙，所述绞龙的外侧侧壁套设有套杆，且套杆位于下方的侧壁上开设有进料口，所述绞龙贯穿箱体的底部侧壁设置，所述绞龙为中空结构，且绞龙的侧壁上开设有多个排水孔，所述箱体的外侧侧壁上固定连接有两个第二电机。本实用新型涉及防治农业面源污染领域，通过破碎轮将污水中大块的固体碾碎，通过设置有排水孔的绞龙，可实现固液分离的作用。