本实用新型涉及一种抗菌功能的运动鞋垫，包括鞋垫本体，设置在鞋垫本体上端面的用于接触人体足部的接触层，在接触层上对应人体脚趾的端部设置有用于分开脚趾的四个分趾部，在鞋垫本体对应脚掌的位置处设置有第一中空部，中空部内设置有一填充有抗菌药剂的抗菌药包，所述鞋垫本体对应足弓的位置处设置有第二中空部，在第二中空部内设置有用于吸附水份的吸水包。本实用新型在在第一中空部中设置了抗菌药包，抗菌包内的药剂可通过贯穿孔散布到鞋内，在第二中空部内设置了吸水包，可降低在运动时鞋内的湿度，有效抑制鞋内真菌的繁殖，且抗菌药包和吸水包均可更换，保证了鞋垫的抗菌时效。