本实用新型属于鞋垫技术领域，尤其为多层抗菌鞋垫，包括鞋垫本体，所述鞋垫本体包括置脚层，所述置脚层的一侧设置有抑菌层，所述抑菌层的一侧设置有底层，所述置脚层包括第一无纺布层。该多层抗菌鞋垫，通过在置脚层和底层的内部设置带有透气孔的天然乳胶垫，一方面利用天然乳胶垫的柔软度提高使用者的舒适度，而且在行走中对使用者的脚部能够起到减震的作用，提高鞋垫的实用性，另一方面利用天然乳胶垫表面的透气孔对使用者的脚部进行通风，由于置脚层和底层之间有抑菌层，利用透气孔能够充分发挥抑菌层中抗菌材料的作用，减少使用者角度的汗液，提高抑菌效果，避免使用者脚部出汗过多汗液无法排出降低抗菌材料的抑菌效果。