本实用新型公开了多功能渔船航行信号灯控制器，涉及航行灯技术领域，包括控制器主体、防水壳体和防护组件，所述控制器主体的正面设置有控制面板，所述控制面板的左侧固定有显示屏，且显示屏的上方安装有指示灯，所述控制面板的右侧上方安装有电源按钮和蜂鸣器按钮，且电源按钮的下方安装有控制灯按钮，所述控制灯按钮的下方安装有复位开关，所述防水壳体固定于控制器主体的后方外侧，且控制器主体的内部安装有电路板，所述电路板的四角设置有螺纹孔，且电路板的外侧涂覆有防水胶层；本实用新型的有益效果是：该装置通过对防水壳体的设置便于对电路板进行防水保护，防止水汽进入内部影响电路板，从而避免海上的潮湿气候对电路板造成影响。