本实用新型公开了一种分布式微水发电系统，包括导流渠和安装在导流渠上的多台微水发电机构，每台微水发电机构均串联逆变控制器，串联后的多个逆变控制器连接有升压器，升压器的输出端连接有变压器，所述变压器通过导线与电源连接，微水发电机构包括水车、离合器、变速箱和低速永磁直驱发电机，水车上通过离合器与变速箱连接，变速箱与低速永磁直驱发电机连接，低速永磁直驱发电机与逆变控制器连接，相邻微水发电机构之间水流产生的水能可带动微水发电机构正常工作。本实用新型通过水车带动离合器转动，离合器带动变速箱转动，变速箱增速后带动低速永磁直驱发电机将水流产生的微小势能转换为微小的电流，以实现发电的目的。