本实用新型公开了一种水生态系统底栖动物构建装置，包括多个可拼接的浮床和安装在浮床底部的多组网箱，所述浮床包括支撑框和安装在支撑框底部的漂浮框，所述支撑框上设有供气机构和多组带动网箱升降的绕线机构，所述网箱的侧壁上加工有与绕线机构连接的固定耳，所述固定耳上设有可与拉线固定的活动线夹，所述支撑框上还设有植物床。本实用新型通过在浮床底部设置多组网箱，可将在水库、湖泊内搭建立体的底栖动物构建系统，利用富营养化的水体作为网箱内底栖动物的养料，节省了底栖动物的饲养成本，同时在处理富营养化的水体时可产生经济效益，用于节省水体处理的成本。