本申请涉及一种构建动物脑模板的方法及装置，其中，所述方法包括：获取至少一个待测动物的头部图像，所述头部图像包括脑部磁共振图像；利用所述至少一个待测动物的头部图像，构建标注有脑部关键点的磁共振成像脑模板，其中，所述脑部关键点设置于颅骨区域上。一方面，申请人在科研过程中发现，很多动物的脑部结构相似，那么，基于至少一个待测动物的脑部磁共振图像，能够构建得到具有科研价值的磁共振成像脑模板。另一方面，将所述脑部关键点设置于颅骨区域中，颅骨区域上的关键点相对于其他脑部其他部分更具有代表性，并且，在其他医学图像中颅骨区域上的关键点也更容易确定，比较容易将其他医学图像与所述磁共振成像脑模板进行匹配。