本实用新型公开了一种小分子肽加工工艺中的搅拌清洗设备，包括底板，所述底板的上表面中心位置固定装配有电机，所述电机转轴的外壁固定套接有套杆，所述套杆的左右两侧均固定装配有支架，所述支架的外侧面固定装配有毛刷，所述套杆的顶端固定装配有托板。通过卡槽和卡块带动搅拌罐转动，搅拌罐内部的原料在搅拌罐转动的过程中充分的混合，达到搅拌的目的，通过支架和毛刷的配合，在搅拌完成之后将搅拌罐倒置，将原料倒出，将搅拌罐套接到支架和毛刷的外侧，使毛刷与搅拌罐的内壁充分的接触，达到清洗的目的，在搅拌过后能够及时的进行清洗，搅拌的操作与清洗的操作之间切换方便，提高了清洗的效率，实用性能强。