本实用新型涉及摇瓶机技术领域，且公开了一种生物细胞用摇瓶机双层调节机构，包括摇瓶机本体，所述摇瓶机本体的顶部设置有下摆放架，所述下摆放架的上方设置有上摆放架，所述下摆放架顶部的四角均固定安装有导向管，所述导向管的内部设置有导向杆，所述导向杆的顶端固定安装于上摆放架的底部。该生物细胞用摇瓶机双层调节机构，通过驱动电机带动主动转轴转动，然后通过皮带带动从动转轴转动，从而使得套管转动，通过套管和螺纹槽的转动使得螺纹杆在螺纹槽的内部上下移动，然后通过导向管和第二滑块对导向杆进行导向和限位，使其在调节高度的同时能够更加平稳的上升，从而达到了能够调节高度，使摇瓶机适用性更广的目的。