本实用新型公开了一种生物技术研究用水体微生物采集装置，包括收纳筒，所述收纳筒呈水平放置，且收纳筒圆周外壁的顶部中间位置通过螺栓安装有竖直放置的固定杆，所述收纳筒圆周外壁的一侧通过螺栓安装有水平放置的采集管，所述采集管的顶部外壁开设有穿槽，且穿槽的两端和两侧内壁之间滑动连接有同一个竖直放置的密封块，所述采集管底部内壁与密封块对应的位置开设有卡槽。将采集管对准活水的水流方向，使水流带动微生物进入到收纳筒中，采集完成后反向旋转操作杆，使密封块底部伸进卡槽中，利用密封条和密封槽进行密封，再提起装置，从而在水中对采集的水体微生物样品进行密封，避免暴露在外部空气造成菌落变化。