本实用新型公开了一种基于生物细胞技术开发用微生物水体采样设备，包括采样箱、样品瓶和取样机构，所述采样箱包括箱壳和箱盖，所述箱盖安装在箱壳的上端面，且箱盖与箱壳转动连接，所述样品瓶均匀的设置在箱壳的中部，且样品瓶与箱壳固定连接，所述取样机构安装在箱壳的侧面，且取样机构与箱壳可拆卸固定连接，保证使用者需要使用的时候可以稳定的通过箱壳来稳定的安装样品瓶来使用，这样使用者就可以通过样品瓶来灵活的进行存放样品水源来使用，同时使用者还可以通过样品瓶来直接进行实验处理，方便使用者可以通过在透明瓶的内部滴入相应的实际来进行观察水样变化，同时可以通过多个透明瓶之间的样品变化来对比实验。