本实用新型公开了一种具有自锁密封结构的双轴输出减速机，包括减速机本体、第一密封盖、第二密封盖和贯穿螺栓，所述减速机本体的边侧开设有侧槽和螺纹槽，所述锁定板边侧与限位板内侧相互连接，且限位板固定在第一密封盖外侧，并且限位板上安装有定位螺栓，所述减速机本体的边侧与第二密封盖贴合，且减速机本体和第二密封盖的边侧均开设有轨迹槽，并且轨迹槽与定位板相互连接，所述贯穿螺栓与轨迹槽相互连接。该具有自锁密封结构的双轴输出减速机，采用新型的锁定结构设计，使得本装置中的密封盖可以与减速机本体紧密的连接接触，保证整体的密封性，且可以有效避免减速机自身工作产生的震动以及所连机器的震动令密封盖错位。