本实用新型提供一种基于烟道测量的二氧化碳排放监测系统，其包括烟气测量装置、烟气采样及预处理装置、样气分析装置、工控机和反吹装置，所述烟气测量装置与所述工控机连接，所述烟气采样及预处理装置与所述样气分析装置连接，所述样气分析装置与所述工控机连接，所述反吹装置与所述烟气采样及预处理装置连接。本实用新型可以有效对烟道内的CO2排放参数进行监测，通过采用全截面矩阵式烟气流量计有效提高了烟气流量测量的准确性，在引压管内设置自动清灰棒有效降低了流量计被堵塞的概率，通过设置反吹装置，可以实现样气采集探头免拆卸清洗。