本实用新型公开了一种浅水层底泥柱状分层采样装置，包括限位套筒、可滑动地插入到限位套筒中的采样管，所述采样管从限位套筒的下端插入并且采样管的下端从限位套筒的下端伸出，所述采样管的下端开口，在所述采样管的下端连接有中空的端盖，在所述端盖的中空部分内设置有多个扇片，多个所述扇片相对于端盖的中心线等角度设置，并且每个扇片远离端盖的中心线的一端铰接在端盖上，当所述扇片处于第一位置时，各个扇片的侧壁相互接触，并组成一个圆形以将端盖的中空部分堵住，当扇片处于第二位置时，各个扇片的自由端朝向倾斜。该浅水层底泥柱状分层采样装置，结构简单，方便携带，使用灵活。