本实用新型公开了一种内置冷却流道的高压均质机，包括储料罐、动力部件、泵体部件和调压部件，泵体部件包括泵体和柱塞，泵体内设置有工作腔，柱塞的一端可滑动地伸入工作腔的一侧，柱塞的另一端与动力部件的输出端相连，破碎装置设置在泵体内并位于工作腔的另一侧，调压部件包括手轮、顶杆和碟簧，泵体内设置有冷却流道，冷却流道设置在工作腔的外侧，泵体的两侧壁上分别设置有入水口和出水口，入水口和出水口分别与冷却流道相通，入水口经管道与外部冷却水供应系统相连。该均质机的泵体中内置有冷却流道，可对工作腔内的液体起到较好的冷却降温效果，避免样品温度急剧升高，从而有效保证样品中生物细胞的活性。