本实用新型公开了一种细胞检测仪器用搅拌棒机构，包括“十字型”安装板，“十字型”安装板相对的两端分别安装有第一电机和搅拌机构，“十字型”安装板上另一方向的两端分别设有安装直线导轨的安装孔，直线导轨上端安装有第二电机，第二电机的动力输出端垂直朝下连接有滚珠丝杠，滚珠丝杠上套设有轴承座，轴承座安装在“十字型”安装板中部的安装孔内，第一电机的动力输出端安装有主动轮，主动轮上套设有皮带，皮带另一端套设在从动轮上，搅拌机构包括搅拌轴和套设在搅拌轴上的从动轮，搅拌轴外壁设有螺旋状凸起。本实用新型结构紧凑简单，能够适用于不同型号的细胞检测仪器；本实用新型能够在搅拌的过程中实时取样，保证样液的均匀性和时效性。