本实用新型涉及搅拌装置技术领域，具体为一种微生物发酵的搅拌装置，包括搅拌桶，搅拌桶的底部靠近边缘处设有若干以环形阵列排布的支腿，支腿靠近中部的位置设有支撑板，支撑板的顶部设有搅拌电机，搅拌桶的底部中心处设有机械密封件，搅拌电机输出轴的端部设有第一转轴，第一转轴的圆周外壁且靠近顶部边缘的位置设有第一螺旋桨，第一转轴的顶部设有第二转轴。该微生物发酵的搅拌装置，通过第一刮板、第二刮板和第三刮板可以将搅拌桶内壁的附着物挂出进行搅拌，避免了微生物发酵时部分原料附着后无法与其他原料进行混合的情况，通过第一螺旋桨和第二螺旋桨可以使搅拌时的原料不会发生沉淀，通过第一转轴和第二转轴可以便于搅拌结构的拆卸清洗。