本实用新型公开了一种复合微生物菌剂的发酵设备，包括发酵釜，所述发酵釜左右两壁中部密封设置有内导热板，所述内导热板外侧焊接有外导热板，所述外导热板内安装有水冷管，所述发酵釜左右两外壁靠近外导热板的外侧安装有凵型架，所述凵型架内中部安装有散热罩，所述散热罩内安装有散热扇。本实用新型通过安装有水冷管，可以通过内导热板和外导热板吸入发酵釜内生物菌剂物料搅拌产生的热量，将水冷管的两组进出水管与外界供水装置连通，由水冷管内的冷水吸入外导热板热量，再由散热扇加速外导热板周边的空气流通，防止微生物菌剂物料搅拌期间摩擦升温变性，提高复合微生物菌剂产品的质量，适合广泛推广与使用。