本实用新型公开一种水体检测采样系统，包括采样装置和接样装置，所述的采样装置设置有若干并分布在各个检测点，所述的采样装置包括密封的采样罐，所述的采样罐上设置了伸入至水体中的进水管，进水管上设置有进水电磁阀，所述的采样罐上还设置有出水管，出水管上设置有出水电磁阀，所述的采样罐上还设置有气路管，气路管连接着将采样罐内气体抽出以及向采样罐内注入气体的抽气注气机构，各个检测点处的采样装置的出水管汇合至总管，总管连接至接样装置，所述的接样装置包括用于接收从总管输送出的样本的样本容器。本实用新型无需人工到实地的检测点进行采样，极大的降低了劳动强度，提高水体检测工作的整体效率。