本实用新型公开了一种脱氮除磷的多介质土壤层污水处理系统，沿垂直方向由上至下布置依次包括用以对流入的污水进行初级净化以除去重金属离子几大颗粒物的种植层，用以接收来自种植层的污水并进行除磷处理的第一厌氧层，用以对第一厌氧层流至的污水进行有机物降解处理以及对含氮物进行氧化处理的好氧层，用以对来自所述好氧层的污水进行脱氮处理的第二厌氧层，其中，所述第二厌氧层的下方具有一用于对经过该第二厌氧层处理的水进行沉淀净化的沉淀层，该沉淀层具有出水口。该技术，采用种植层以及厌氧‑好氧‑厌氧的布置依次实现了重金属和颗粒物过滤、除磷处理以及除氮处理，其功能结构分明、简单，功能多，而且能够提高脱氮除磷效率。